Die intensive Pflege der Werke Johann Sebastian Bachs, verbunden mit der Namensgebung des Chores, erfolgte ab 1945 unter dem damaligen Stadtkantor Gustav Sasse. Das erste Konzert mit Kantaten von Johann Sebastian Bach fand am 27. Oktober 1945 in der Dreifaltigkeitskirche statt.
Unter der Leitung von Manfred Brandstetter von 1967 an wurde das Repertoire um bekannte und weniger bekannte Werke aus Romantik und Klassischer Moderne erweitert.
Seit 1986 wird der Chor von Jörg Straube geleitet. Er setzt die Tradition der oratorischen Konzerte mit Werken von Monteverdi, Bach, Mozart, Mendelssohn und Verdi fort, unternimmt aber auch immer wieder das Wagnis, dem Publikum weniger bekannte Werke vorzustellen (unter anderem von Max Reger, Frank Martin oder Arthur Honegger).
Gemeinsam mit anderen hannoverschen Chören wurde der Bachchor 2010 mit dem Echo Klassik ausgezeichnet.